Aj keď masky FFP aj chirurgické masky ponúkajú určitú úroveň ochrany proti časticiam prenášaným vzduchom, slúžia na odlišné účely a poskytujú rôzne úrovne filtrácie. FFP masky sú navrhnuté pre vynikajúcu filtráciu. Chirurgická maska na tvár na druhej strane primárne blokuje postriekanie a spóry húb.
Okrem toho masky FFP primárne chránia nositeľa pred vdychovaním vzduchom prenášaných nečistôt a veľmi jemných častíc. Ich pevné uloženie a vysoká účinnosť filtrácie ich robí vhodnými do prostredia s prachom, výparmi a dokonca aj niektorými nebezpečnými materiálmi. Chirurgické masky sú naproti tomu navrhnuté tak, aby chránili ostatných pred kvapôčkami dýchacích ciest nositeľa. Bežne sa používajú v lekárskom prostredí, aby sa zabránilo šíreniu baktérií počas procedúr alebo jednotlivcami, ktorí môžu byť chorí.